Selon l’article 2 de ses statuts, l’IESH poursuit les objectifs suivants :

L'association s'emploie à réaliser les objectifs suivants: 

• La création d'établissements d'enseignement des sciences humaines.
• La pratique publique de l'enseignement théologique.
• L'organisation et la dispense de conférences et de sessions de formation et de perfectionnement dans les sciences humaines et théologiques pour un public des deux sexes sans distinction.
• La délivrance de certificats d'études supérieures dans le domaine des sciences religieuses
• L'élaboration et publication d'études et de recherches.
• La promotion de la connaissance de la religion, culture et civilisation musulmane avec tous les moyens appropriés.
• La coordination et la coopération avec des institutions ayant des objectifs similaires.