Depuis 1980, quelques responsables de la communauté musulmane de France et d'Europe, ont ressenti un grand besoin de formation des cadres musulmans et d’imams européens.
Les dirigeants de la Fédération des Organisations Islamiques d'Europe (FOIE) étaient convaincus qu'il fallait donner à l'islam des structures stables répondant aux besoins des musulmans, tout en tenant compte des spécificités de la réalité environnante.
 En effet, cette formation devait répondre à deux exigences :

1. une qualification théologique (Sciences islamiques)
2. une connaissance de la réalité occidentale (Sciences humaines

L'idée consistait à créer un institut d'enseignement de la théologie musulmane en Europe, qui devait répondre aux besoins de la communauté et accompagner l’évolution des musulmans qui sont devenus désormais des citoyens européens. C’était le moyen le plus efficace de réussir l'intégration des musulmans dans ces sociétés européennes.
C’est ainsi que l'Institut Européen des Sciences Humaines (IESH) association loi 1901, a été créé.

1. en 1991 à Château-Chinon, c’était le premier établissement européen spécialisé dans l'enseignement des études islamiques, de la langue arabe et dans le Coran.
2. en 1997, un deuxième établissement voit le jour à Wales (Pays du Galles en Grande Bretagne)
3. puis en 2001, l’ouverture d’un troisième en région parisienne : IESH de Paris.

Afin de répondre à une forte demande en formation théologique, l'IESH de Paris à mis tout en place pour faciliter l'accès aux études islamiques tant en français qu’en arabe, sur place ou à distance.
Les programmes scientifiques de l’IESH sont élaborés par un Conseil scientifique composé de plusieurs éminents professeurs et chercheurs des universités islamiques les plus réputées dans le monde arabe. Un Comité Scientifique composé des professeurs de l’IESH suivent l’application de ces programmes et leur amélioration dans les différents établissements.
Les enseignants de l’IESH de Paris sont tous diplômés des plus prestigieuses universités (La Sorbonne, Ez-zeïtouna en Tunisie, Emir Abdel-Qader en Algérie, Médine en Arabie Saoudite, …), avec un Bac+5 ou un Doctorat dans leurs disciplines respectives.

L’IESH de Paris est déclaré à l’Académie de Créteil en tant qu’établissement d’enseignement Supérieur Privé et immatriculé sous le numéro : 093-2465 Z. Il est reconnu par le Ministère de l’Education Nationale : Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche pour son niveau d’enseignement supérieur.
Depuis sa création, l’IESH de Paris a signé des accords de collaboration avec de nombreuses universités de théologie musulmane à travers le monde arabo-musulman : Université d’Alger (Algérie) et Université Mohamed-V de Rabat (Maroc). Ces accords permettent la reconnaissance des titres et certificats délivrés par l’IESH de Paris en fin de cursus (diplômes conjoints avec l’université).